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【新冠专区】文献解读 | WHO官宣Deltacron存在,重组毒株有何不同?

2022-03-28 13:12    浏览量:983

2022年3月14日,#德尔塔克戎变体开始传播#的词条登上微博热搜。很快,“双毒合一”Deltacron相关新闻的报道再次铺天盖地的袭来。实际上,有关Delta与Omicron重组的消息从去年 12 月开始就一直络绎不绝,却最终都被证实是谣言或序列污染导致。

然而,就在大家纷纷认为本次有关“Deltacron”开始传播的报道仍是误会和谣言时,法国巴斯德研究所近日在medRxiv发表了题为“Culture and identification of a “Deltamicron” SARS-CoV-2 in a three cases cluster in southern France”的预印本研究论文,报告了对在法国出现的”Deltacron“感染病例的研究成果。WHO新冠技术负责人Maria Van Kerkhove在例行新闻发布会上表示在关注有关Deltacron的情况,且证实了该毒株已开始在法国,丹麦、德国和荷兰等在内的地区出现。


通过对样本的基因序列进行分析,科学家确认Delta 21J/AY.4和Omicron 21K/BA.1毒株发生基因重组,该重组毒株主要由Omicron 21K/BA.1突变中表达刺突蛋白的基因区域和Delta 21J/AY.4突变的骨架部分组成。

图1. SARS-CoV-2 Delta 21J/AY.4-Omicron 21K/BA.1 重组基因组示意图


研究人员进一步对重组毒株的Spike蛋白结构进行了分析预测。结果表明,该重组毒株相比与Delta和Omicron变异毒株,主要的结构变化位于N端结构域(NTD)。在病毒与宿主细胞质膜的初始相互作用中,NTD区域被脂质筏吸引,为刺突蛋白提供了一个负电着陆平台。基因序列的改变使得“Deltacron”刺突蛋白的表面扩大、变平并更具正电性,从而可能导致NTD正电表面增加并加速病毒与脂质筏的结合,进而赋予其选择性动力学优势。AY.4 x BA.1重组毒株的受体结合结构域(RBD)主要来自Omicron变异毒株,同时增加了RBD的静电表面电位,可能促进其与ACE2细胞受体的负电界面的相互作用。综上,AY.4 x BA.1重组毒株的刺突蛋白基因序列的改变可能会导致病毒与宿主细胞膜的结合能力提升。

图 2. SARS-CoV-2 Delta 21J/AY.4-Omicron 21K/BA.1重组体的刺突蛋白预测结构示意图


随着AY.4 x BA.1重组变异毒株的真实性被进一步证实,面对突变需要考虑的重点问题再次引发了人们的思考:

  • - 它是否更容易复制和传播?

  • - 它是否会导致更严重的症状?

  • - 现有的诊断试剂是否依旧能够有效检出?

  • - 它是否更容易逃逸之前的疫苗接种或自然免疫?

  • - 目前使用的抗体药物或其他抗新冠药物对其是否还有效?


为助力社会各界迅速对上述问题展开研究,ACROBiosystems第一时间参考GISAID数据库,对目前已知的AY.4 x BA.1重组变异毒株基因序列进行比对分析,并迅速立项开发了系列抗原蛋白产品,包括Spike trimer、S1、NTD。产品严格质控,抗原活性和纯度有保证。欢迎相关研究人员及疫苗、抗体药研发企业咨询订购!

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参考文献:

1. Colson P,Fournier PE, Delerce J, Million M, Bedotto M, Houhamdi L, et al. Culture andidentification of a “Deltamicron” SARS-CoV-2 in a three cases cluster in 7southern France. medRxiv. 2022.

2. Ou J, Lan W, Wu X, Zhao T, Duan B, Yang P,et al. Tracking SARS-CoV-2 Omicron diverse spike gene mutations identifiesmultiple inter-variant recombination events. biorxiv. 2022.

3. Bolze A, White S, Basler T, Dei Rossi A,Roychoudhury P, Greninger AL, et al. Evidence for SARS-CoV-2 Delta and Omicronco-infections and recombination. medrxiv. 2022.

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