From WHO:世界卫生组织在9月21日发布最新的COVID流行病学报告中指出,过去一个月中Omicron谱系仍占全球新发病例中的99%。然而,与过往的主流突变株不同,Omicron变异具有多分支谱系和显著的遗传多样化。当前全球相对流行率最高的变异株仍为BA.5(76%),BA.2.75及BA.5子谱系虽然当前流行率较低,但在过去四周内有显著增长。
From CDC:美国疾病控制与预防中心通过美国国家基因组监测系统对新冠病毒及其突变株序列进行监控与预测,结果显示,截至9月24日,BA.5仍为美国当前主要突变株,占美国全国测序结果约83%。此外,新SARS-CoV-2变异株BA.4.6及BF.7在美国病例数占比在近一个月内持续增长并已经超过BA.4。
Variant Proportions in USA, from CDC
近日,北京大学谢晓亮、曹云龙团队在Biorxiv发布预印本文章,就上述多个增长趋势优于当前主流突变株BA.5的子变体突变位点及其对疫苗接种和感染建立的体液免疫的影响进行了分析与研究。
通过对目前具有显著增长优势的多个衍生新冠病毒变异株的突变位点进行分析,发现其在Spike RBD区域的突变集中在一些相同位点,包括R346、R356、K444、L452、N460K 和 F486。通过Spike蛋白假病毒对现有治疗性中和抗体对携带有协同突变位点的衍生变异毒株的中和活性进行验证,包括 Evusheld 和 Bebtelovimab。结果表明,Evusheld易受到F486 、R346和 K444突变的影响,Bebtelovimab由于K444突变导致其对BA.2.381、BA.5.2.7等突变株的活性显著降低。相对的,当前处于临床前开发阶段的靶向非竞争性保守表位的广谱性中和抗体对SA55+SA58对该实验中测试的Omicron衍生变体表现出较高的中和效果。
新冠病毒最新衍生子谱系突变位点
为验证当前疫苗接种对于新突变株的免疫保护效果,研究人员测试了已接受三剂基于野生型病毒开发的灭活疫苗的血浆样本对于衍生变异毒株的中和效果。结果显示,与BA.2相比,所测试的所有BA.2子变体NT50值(50% neutralization titer)均有显著降低。其中,BA.2.75.2在接受测试的子变体中具有最强的免疫逃逸能力,与BA.2.75相比,该子变体BA.2.75.2会导致3剂灭活疫苗接种者(4.2倍)、BA.1突破性感染患者(5.9倍)、BA.2突破性感染患者(6.2倍)及BA.5突破性感染患者(2.7倍)血浆的NT50值降低。这意味着,趋同进化可能会导致大规模的免疫逃逸,导致现有的疫苗失效。不仅如此,系列子变体对BA.5突破性感染恢复期患者血浆的逃逸能力预示着基于BA.5变异毒株设计的新一代加强针疫苗可能无法对现有及未来的衍生突变株实现广谱的免疫保护效果。
3剂灭活疫苗接种者、BA.1突破性感染患者、BA.2突破性感染患者及BA.5突破性感染患者对子谱系变异毒株的中和活性1
实验结果表明,通过自然感染建立的群体免疫几乎无法阻止新冠病毒RBD结构域的突变与进化,现有的基于野生型病毒开发的及基于BA.5变异毒株开发的疫苗加强剂可能均无法提供足够广泛的免疫保护效果。因此,研究人员仍需对新出现的优势变异毒株保持关注并对其进行研究,具有广谱保护效果的新冠疫苗和治疗性抗体药物开发也应作为开发的较高优先级。
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✿ 经ELISA验证,特异性抗体(Cat. No. SPD-Y77)可以特异性结合BA.2(Cat. No. SPD-C522g)、BA.2.12.1(Cat. No. SPD-C522q)、BA.4/5(Cat. No. SPD-C522r)RBD蛋白,与其他突变株RBD蛋白不结合。
✿ 经SDS-PAGE验证,BA.4.6 Spike蛋白 (Cat. No. SPN-C522m)纯度大于95%;经SEC-MALS验证蛋白三聚体纯度大于90%。
The purity of SARS-CoV-2 Spike Trimer, His Tag (BA.4.6/Omicron) (Cat. No. SPN-C522m) is more than 90% and the molecular weight of this protein is around 520-565 kDa verified by SEC-MALS.
1. Cao, Y., Jian, F., Wang, J., Yu, Y., Song, W., Yisimayi, A., An, R., Zhang, N., Wang, Y., Wang, P., Zhao, L., Sun, H., Yu, L., Yang, S., Niu, X., Xiao, T., Gu, Q., Shao, F., Hao, X., … Xie, S. (n.d.). Imprinted SARS-CoV-2 humoral immunity induces converging Omicron RBD evolution Division of HIV/AIDS and Sex-transmitted Virus Vaccines, Institute for Biological Product. https://doi.org/10.1101/2022.09.15.507787
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